مجله علوم و فنون دریایی

مجله علوم و فنون دریایی

بررسی مولکولی جمعیت میگوی موزی ( Fenneropenaeus merguiensis) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره در صیدگاه های خلیج فارس

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان
1 اداره کل شیلات استان بوشهر، بوشهر، ایران.
2 گروه زیست شناسی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر، خرمشهر، ایران.
چکیده
شناسایی ساختار ژنتیکی ذخایر دریایی کشور، شیوه‌ای مؤثر در مدیریت کارآمد شیلاتی محسوب می‌گردد. یکی از گونه‌های با ارزش میگو در خلیج فارس، میگوی موزی (Fenneropenaeus merguiensis) است که حدود 60 درصد از کل صید سالانه میگو در استان هرمزگان را شامل می‌شود. در این مطالعه، میزان تنوع ژنتیکی در جمعیت این گونه در چهار صیدگاه گروک، کلاهی، نیروگاه بندرعباس و طولا و همچنین جمعیت میگوهای یک گرمی رهاسازی شده در خوریات کلاهی با استفاده از نشانگر ریزماهواره و 10 پرایمر مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل از ماتریس فاصله ژنتیکی (Fst) نشان‌دهنده بیشترین و کمترین فاصله ژنتیکی به ترتیب بین صیدگاه‌های گروک-طولا و نیروگاه بندرعباس-کلاهی به میزان 0/065 و 0/01 (0/05≤p) بود. همچنین، تحلیل شارش ژنی در بین جمعیت‌ها و صیدگاه‌های مورد بررسی نشان داد که کمترین و بیشترین مقدار به ترتیب در جمعیت صیدگاه‌های کلاهی-نیروگاه و گروک-طولا به میزان 7/815 و 73/3 مشاهده شد. مقادیر هتروزیگوسیتی مورد انتظار و مشاهده‌شده در دامنه غیرمعنادار و به ترتیب با میانگین 0/008±0/679 و 0/02±0/482قرار داشت. بیشترین و کمترین میزان فراوانی آللی در جمعیت‌های مورد بررسی، به ترتیب مربوط به صیدگاه گروک با 0/2 ± 4/8 و 0/133 ± 3/8 بود. کمترین و بیشترین تعداد آلل‌های اختصاصی مربوط به جمعیت صیدگاه طولا و جمعیت میگوهای رهاسازی شده به میزان صفر (0) و جمعیت صیدگاه نیروگاه بندرعباس به تعداد 0/213 ±3 آلل ثبت شد. آزمون سنجش ژنتیکی (Assignment test) نشان‌دهنده بیشترین و کمترین واگرایی به ترتیب بین جمعیت میگوهای رهاسازی شده و صیدگاه طولا به میزان 2/897 ± 13/063- و صیدگاه کلاهی و نیروگاه به میزان 2/119 ± 8/255- بود. بر این اساس، می‌توان نتیجه گرفت که بازسازی ذخایر میگوی گونه F. merguiensis نقش منفی بر تنوع ژنتیکی در جمعیت این صیدگاه‌ها نداشته و فاصله از رویشگاه‌های حرّا و تأثیر جریان‌های هیدرودینامیک منطقه‌ای بر انتشار لاروهای پلاژیک در مناطق شرقی و غربی استان هرمزگان، نقش تعیین‌کننده‌ای بر فاصله ژنتیکی و جریان ژنی بین جمعیت میگوها در این استان دارد. لذا لازم است پروژه‌های بازسازی ذخایر این گونه با توجه به این عوامل اجرا گردد.
کلیدواژه‌ها

موضوعات


Cao, Y.Y., Shangguan, J.B. and Li, Z.B., 2017. Population genetic analysis and conservation strategies for redtail shrimp Fenneropenaeus penicillatus using ten microsatellite markers. Genetics and Molecular Research, 16(1), pp.108-112. https://doi.org/10.4238/gmr160 19068
FAO (Food and Agriculture Organization of the United Nations)., 2018. The State of World Fisheries and Aquaculture 2018. Food and Agriculture Organization: Rome, 227 pp.
Gopalakrishnan, A., Jayasankar, J., Shah, P. and Shalin, S., 2017. Genetic stock characterization of fish using molecular markers in Course manual summer school on advanced methods for fish stock assessment and fisheries management. Lecture Note Series, 2, pp.308-316.
Holleley, C.E. and Geerts, P.G., 2009. Multiplex Manager 1.0: a cross-platform computer program that plans and optimizes multiplex PCR. BioTechniques, 46(7), pp. 511-517. https://doi.org/ 10.2144/000113156
Holsinger, K.E. and Weir, B.S., 2009. Genetics in geographically structured populations: defining, estimating and interpreting F ST. Nature Reviews Genetics, 10(9), 639-650. https://doi.org/ 10.1038/nrg2611
Holthuis, L.B. 1980. FAO species catalogue. Vol. 1 Shrimps and prawns of the world. An annotated catalogue of species of interest to fisheries. 125, pp. 271.
Litt, M. and Luty, J.A., 1989. A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac muscle actin gene. American Journal of Human Genetics, 44(3), pp. 397.
Liu, Z., Li, P., Kocabas, A., Karsi, A. and Ju, Z., 2001. Microsatellite-containing genes from the channel catfish brain: evidence of trinucleotide repeat expansion in the coding region of nucleotide excision repair gene RAD23B. Biochemical and Biophysical Research Communications, 289(2), pp. 317-324. https://doi.org/10.1006/bbrc.2001.5978
McMillen-Jackson, A.L. and Bert, T.M. 2004. Genetic diversity in the mtDNA control region and population structure in the pink shrimp Farfantepenaeus duorarum. Journal of Crustacean Biology, 24(1), pp.101-109. https://doi.org/10.1651/C-2372
Momeni, M., Keymaram, F., Salarpouri, A., Behzadi, S., Darvishi, M., Khajehnouri, K. and Safaei, M., 2015. Stock assessment of Banana shrimp (Penaeus merguiensis) in coastal waters of Hormozgan province. Iranian Fisheries Science Research Institute. (In Persian)
O'connell, M. and Wright, J.M., 1997. Microsatellite DNA in fishes. Reviews in Fish Biology and Fisheries, 7, pp. 331-363. https://doi.org/10.1023/A:1018443912945
Shokoohmand, M., Zolgharneen, H., Laloei, F., Fooroghmand, A.M. and Savari, A., 2011. Genetic variation of Metapenaeus affinis in Persian Gulf coastal waters using microsatellite markers. Iranian Scientific Fisheries Journal, 20(3), 45-54. https://doi.org/2010.22092/ISFJ.2017.110006. (In Persian).
Supungul, P., Sootanan, P., Klinbunga, S., Kamonrat, W., Jarayabhand, P. and Tassanakajon, A., 2000. Microsatellite polymorphism and the population structure of the black tiger shrimp (Penaeus monodon) in Thailand. Marine Biotechnology, 2, pp. 339-347. https://doi.org/10.1007/s101260000012
Tautz, D. 1989. Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers. Nucleic Acids Research, 17(16), pp. 6463-6471. https://doi.org/ 10.1093/nar/17.16.6463
Tamadoni Jahromi, S., Rezvani Gilkolaei, S., Ghadirnejad, S. H., Ghoroghi, A., Tala, M. and Sadeghi, M. R., 2014. Molecular investigation of banana shrimp (P. merguiensis) populations from Persian Gulf and Oman sea using microsatellite markers. Journal of Veterinary Research, 69(1), pp. 85-93. doi: 10.22059/jvr.2014.36716. (In Persian)
Taylor, A.C., Sherwin, W.B. and Wayne, R.K., 1994. Genetic variation of microsatellite loci in a bottlenecked species: the northern hairy‐nosed wombat Lasiorhinus krefftii. Molecular Ecology, 3(4), pp. 277-290. https://doi.org/ 10.1111/j.1365-294X.1994.tb00068.x
Valles-Jimenez, R., Cruz, P. and Perez-Enriquez, R., 2004. Population genetic structure of Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei) from Mexico to Panama: microsatellite DNA variation. Marine Biotechnology, 6, pp. 475-484. https://doi.org/10.1007/s10126-004-3138-6
Vance, D.J., Staples, D.J. and Kerr, J.D., 1985. Factors affecting year-to-year variation in the catch of banana prawns (Penaeus merguiensis) in the Gulf of Carpentaria, Australia. ICES Journal of Marine Science, 42(1), pp. 83-97. https://doi.org/ 10.1093/icesjms/42.1.83
Weersing, K. and Toonen, R.J., 2009. Population genetics, larval dispersal, and connectivity in marine systems. Marine Ecology Progress Series, 393, pp. 1-12. https://doi.org/10.3354/meps08287
Wright, S., 1984. Evolution and the genetics of populations, volume 4: variability within and among natural populations (Vol. 4). University of Chicago press, 590 pp.
Xu, Z., Primavera, J. H., de la Peña, L. D., Pettit, P., Belak, J. and Alcivar-Warren, A., 2001. Genetic diversity of wild and cultured black tiger shrimp (Penaeus monodon) in the Philippines using microsatellites. Aquaculture, 199(1-2), pp. 13-40.  https://doi.org/10.1016/S0044-8486(00)00535-4
You, E.M., Chiu, T.S., Liu, K.F., Tassanakajon, A., Klinbunga, S., Triwitayakorn, K. and Yu, H.T., 2008. Microsatellite and mitochondrial haplotype diversity reveals population differentiation in the tiger shrimp (Penaeus monodon) in the Indo‐Pacific region. Animal Genetics, 39(3), pp. 267-277. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2008.01724.x
 
دوره 23، شماره 4
پاییز 1403
صفحه 73-87

  • تاریخ دریافت 13 مهر 1398
  • تاریخ بازنگری 28 دی 1398
  • تاریخ پذیرش 30 دی 1398
  • تاریخ انتشار 01 آذر 1403